RNAシーケンスとは？DNAとの違いと使い分け
こんにちは、今回は「RNAシーケンス（RNA-seq）」について、研究初心者の方にもわかりやすく解説していきます。
最近では医学研究やバイオの現場でよく使われる技術ですが、「DNAとの違いって？」「何ができるの？」といった疑問も多いはず。今回は実際の鼻茸の研究を例に、RNAシーケンスの基本と活用方法を紹介します。
1. DNAとRNAの違いってなに？
| 項目 | DNA | RNA |
|---|---|---|
| 何か？ | 遺伝情報そのもの（設計図） | 遺伝子からコピーされた命令書 |
| イメージ | 図書館にある全ての本 | 今読まれている本 |
| どこにある？ | 細胞の核 | 核と細胞質 |
→ DNAは「すべての情報」、RNAは「いま使われている情報」
2. シーケンスとは？
シーケンス＝配列を読むこと（遺伝子の文字列を読む）
- DNAシーケンス：どんな遺伝子や変異があるか調べる
- RNAシーケンス：どの遺伝子が使われているか（発現）を調べる
3. DNAとRNAシーケンスの使い分け
| 調べたいこと | 適した方法 | 例 |
|---|---|---|
| 遺伝子に変異があるか？ | DNAシーケンス | 遺伝病、がんの原因調査 |
| どの遺伝子が使われているか？ | RNAシーケンス | 病気の状態、炎症のタイプ |
| 遺伝子が働かない理由を知りたい | 両方使う | 機能喪失＋発現消失の確認 |
DNAシーケンス＝設計図チェック、RNAシーケンス＝実際の活動チェック
4. 鼻茸の研究にRNAシーケンスを活用
参考論文：Nakayama et al., J Allergy Clin Immunol, 2022
慢性副鼻腔炎（CRSwNP）の鼻茸を対象に、白人と日本人の炎症パターンの違いをRNA-seqで解析しました。
研究の流れ（簡略版）
- 鼻茸組織を採取しRNALaterで保存
- RNA抽出・品質チェック
- ライブラリ作成
- 次世代シーケンス（NovaSeq）
- データ解析（STAR、DESeq2など）
5. 研究でわかったこと
- 白人と日本人で「炎症タイプ（エンドタイプ）」は2つに分かれる（type 2と非type 2）
- 構造は共通だが割合が異なる（白人はtype 2が多い）
- type 2ではCCL13、CST1、CCL18が高発現
- M2マクロファージや上皮細胞が主な発現源（scRNA-seqで確認）
6. まとめ：RNAシーケンスは「いま起きていること」を可視化
- DNAシーケンス＝設計図（変異）を調べる
- RNAシーケンス＝今どの遺伝子が働いているかを調べる
- 病気の分類や薬の効果判定などに活用できる
- 実際の研究例を知ると、技術の使いどころがわかりやすくなる！
今後も研究初心者の方に向けて、分子生物学の基本と応用をわかりやすく紹介していきます！
